庄子庙位于蒙城县涡河北岸的齐源镇。庄子（公元前369-286年）与孟子（公元前372-289年）生活在同一时期。庄子比孟子小三岁，名周，字子休。《史记》载：“庄子，孟国人，名周，曾为孟齐源官”，不久便隐居。庄子一生潜心学问，没有担任官职。家境虽然贫寒，但生活十分洒脱。当时楚、梁、齐等国都请他做官，其中楚国请他做相国，他坚决谢绝。 他爱好钓鱼，常在家乡的濮河（今钱江）边钓鱼（蒙城鲁王镇钱江边至今还有庄子钓台遗址）。妻子去世时，他便敲着盆子唱歌。醒来后，不知道是梦中自己变成了蝴蝶，还是蝴蝶变成了他。他的心境可以飞翔到九万里之外，北上北海，南上天空。正如易中天先生所说，庄子的一生是精彩的，充实的，自由的。
庄子庙始建于宋元丰元年（1078年）。当时蒙城县令兼书记王敬感慨家乡一千多年无处纪念庄子，便多方募捐为庄子建庙，并请好友苏轼撰文纪念。苏轼撰《庄子庙记》云：“庄子，孟人，曾为孟漆园官。死后一千余年，孟无祠。县令兼书记王敬始建庙，请文以记之……”此庙建于涡河北岸旧县衙漆园旧址上，主要建筑有逍遥堂、孟蝶楼、观鱼台等。 每年祭祀，从未间断。《苏东坡全集》中收录有《庄子庙记》。这里要提出一个问题，那就是庄子的家乡蒙城为何在一千年后才为庄子建庙？众所周知，庄子生活在战国末期，西汉在他死后八十年（206）才开始统治。汉代“百家废立，独尊儒术”，汉武帝虽然崇尚道教，追求黄老养生长寿之术，在政治上仍然尊崇儒家。东汉末年，道教盛行，老子的地位由道教奠定。虽然庄子也被追封为道教领袖，但其地位远不如老子。 魏晋时期，庄子以其超凡脱俗的人生观、神秘莫测的宇宙观和虚无主义的人生观，受到当时玄学派的追捧，名声大振。但由于社会动荡，为名人建庙尚无风气，所以没人为庄子修建纪念地。唐代只崇拜老子，不崇拜庄子。宋真宗（998—1022年）崇尚道教，全国有兴建道教活动场所之风。宋神宗（1068—1078年）元丰八年（1078年），神宗去世。神宗的母亲高太后因其孙哲宗年幼而统治国家。高太后是蒙城孝建人。 聪明的县令王敬此时修建了庄子庙，不仅是历史发展的需要，符合当时的社会风俗，也有向高太后表示忠心和祝贺的意思。
明天顺年间（1457—1464年），庄子庙被黄河淹没。明万历八年（1580年），县令吴义鸾在县城东门重建。重建的庄子庙规模宏大，蔚为壮观，有逍遥殿、梦蝶楼、卷棚各三间，道观三间，鱼塘上有桥。左为梦蝶楼，右为观鱼台。逍遥殿居中，殿内塑庄周像，每逢春秋祭祀。明崇祯五年（1632年），县令李世芳重建逍遥殿，增建五霄亭，辟水池为庄子豪商观鱼园。 他还撰写了《新庄子庙记》，并在庙内刻了碑，庙门前立着一块高十余尺的石碑，上刻“庄周故里”四个大字。
如今，宋明时期的庄子庙已不复存在，仅存苏轼的《庄子庙记》。
1995年6月28日，蒙城县委、县政府在宋代庄子庙遗址上第三次重建庄子庙，并聘请中国科学院著名古建筑专家张玉环设计总体规划。占地面积52亩，总建筑面积1086平方米。整个庙宇由庙宇建筑群和万树园两部分组成。中轴线贯穿其中，主要建筑排列在中轴线上，左右对称，前后寝。建筑体量前低后高，主次分明，长幼有序。庙宇门多，进正门后还有三道门，分别是古衡门、庄子门、涵雀门，过了这三道门，就能看到逍遥殿（大殿）。 大殿前有左右配门，东西月门，这一大组门成为进入庄子庙大殿前的序幕，步步引人入胜。东西万树园映衬自然，具有自然的野性，这一设计方案超出了历史上历代所建庄子庙的规模。
庄子诗苑重建工程分两期进行，一期工程包括汉墙、东西万树园城墙、三大门、影壁、山门、逍遥殿等，已基本完工；二期工程包括古横门、蒲池、五晓亭、关羽台、关羽桥、梦蝶楼、南华经阁、东西碑廊等。
